FaktorX

выполни последовательно под рутом:

yum clean all
yum makecache

это очистит текущие кэши и пересоздаст их используя /etc/yum.repos.d

Пусть убивает.
в кроне:
*/1 * * * * ~/tmp/check_tomcat.sh >> ~/tmp/check_tomcat.sh.log 2>&1

cat ~/tmp/check_tomcat.sh
#!/bin/bash
if [ $( ps -ef|grep tomcat|grep java|wc -l ) -eq 0 ]
then
echo "tomcat process not found, try to start"
service tomcat start
else
echo "tomcat process found"
fi

можно выяснить банальным bash скриптом
export script_name=my_script
if [ $( for i in $( ps -ef|grep ${script_name} |awk '{print $3}'); do ps -ef | grep $i|grep cron|grep -v grep; done|wc -l ) -eq 0 ]; then echo "run by user"; else echo "run by cron";fi