Михаил

https://github.com/zalog/placeholder-loading

Нужно для li поставить border изначально, но прознрачный, а при ховере менять цвет.

.navigation li {
    border-bottom: 2px solid transparent;
}
.navigation li:hover {
    border-color: white;
}

так?

Вынести меню из врапера который ограничивает ширину, если это не возможно разбить верстку на блоки.
Например:

<div class="wrapper">
 тут блоки
</div>
<div class="menu">Блок с меню на 100%</div>
<div class="wrapper">
 тут снова блоки
</div>