Сообщение говорит о том, что скрипт запользовал всю память и системе пришлось его убить.
Если вы не настраивали специально для него ограничения (например, с помощью cgroups), то они врядли примениимы.Одноко, и cgroups не спасут вас от того, что скрипт использует всю память. Вероятно, нужно посмотреть в сторону оптимизации скрипта.