Если вы хотите загружаться из переносного HDD на разных компьютерах, то попросту запишите образ диска через программу
https://unetbootin.github.io/ и при загрузке системы выбрать запуск без установки, и вот он лайв ОС
2. Если все будет проходить только на 1м компьютере то лучше всего физически отключить остальные диски от мат платы и оставить тот на который будет инсталлироваться система линукс (для безопасности разбития диска)
после чего спокойно не боясь ничего собрать операционную систему
подключить отключенные ранние диски.
При старте компьютера загружаться в boot menu и выбирать диск с которого нужно провести загрузку (F8, F9, F12, Esc) в зависимости от мат платы.