Есть занудная мысль. Можно книгу разбить на отдельные страницы, количество страниц = количество pdf файлов, далее конвертировать pdf в jpeg, автоматизировать процесс открытия картинки, разрезания ее пополам и создания в итоге двух картинок, далее все конвертировать обратно в pdf и склеить в одну книгу.....