Merge Request — это запрос на слияние веток. Нет такого понятия, как «слияние коммитов». Сливаться будет вся цепочка коммитов, которая ответвилась от базовой ветки, а не только тот коммит, который существовал в ветке на момент создания запроса на слияние.
Чтобы создать три запроса, вам нужно раскидать эти коммиты по трем разным веткам.
Для каждого запроса на слияние создается отдельная ветка, потому что нельзя одну и ту же ветку слить дважды разными запросами. Хотите новый запрос — создавайте новую ветку. Ветка создается не откуда попало, а от главной ветки, в которую вы хотите вливаться.
Если вы забыли создать новые тематические ветки для других задач и продолжили коммитить в тематическую ветку первой задачи, то это поправимо. Правда, смысл это исправлять будет только если задачи независимы. Если же, например, вторая задача зависит от кода, добавленного в первой задаче, то у вас может не получиться разделить ветку так, чтобы код остался рабочим.
