Сделай border у блока карусели и увидишь, что сама карусель стоит на месте.
Но стрелки стилями прижаты к низу блока карусели. Они и остаются там все время пока картинки перемещаются на верх.
Как вариант - пересчитывай индекс "первой" картинки таким образом, чтобы снизу всегда оставалось достаточное количество картинок, чтобы не было пустого места до низа блока карусели.
