Лучше найти профильного юриста, чтобы он посмотрел и дал оценку вашим договорам.
По вашему описанию складывается впечатление, что вы оказывайте услуги и проводите работы на серверах заказчика, а также поддерживайте работоспособность оборудования и сети. Вы не поставляйте ПО и не торгуйте им и не устанавливайте его(допустим по договорам под видом лицензионного). Поэтому к нелицензионному ПО, скорее всего, юридически отношения не имеете.
Уточняйте формулировки ваших договоров с юристом.