Собственно, проблема решилась сама собой. Ошибка timeout invalid time interval '/t' появлялась, когда пытался запустить батник в режиме разработчика, из папки, отличной от папки проекта. Собранный билд программы все прекрасно запускает, когда все файлы на своих местах, то ошибки нет. Оставил вариант с shell.openItem(Path.LAUNCHER_UPDATER);