В ячейке D2 впишите формулу:
=IF(COUNTIF($C$2:$C2;C2)<2;"Unique";"Duplicate")
Растяните её на весь столбец D - в нём будут помечены уникальные значения и дубликаты.
Теперь можно поменять основную формулу на:
=UNIQUE(QUERY(FILTER(A1:D4;D1:D4="Unique");"Select Col1, Col2, Col3"))