Преимущество простое, если сайт высоконагруженный, то у него может быть несколько бакендов на разных серверах, на которые балансируется нагрузка. И если хранить сессии в файлах, то юзера будет разлогинивать при переключении сервера.

Еще удобно связывать сессию с конкретным юзером в БД. Можно вводить ограничения типа "нельзя быть залогиненым с двух браузеров", удобно для онлайн игр.

Или дать функционал "Разлогинить меня на всех устройствах".

И еще наверняка куча вариантов.