1) отбираете везде права администратора, где возможно
2) регулярно проверяете все компьютеры на наличие установленного софта (можно даже через WMI)
2.1) при обнаружении любого пиратского софта немедленно удаляете, а пользователя — на линчевание, желательно с материальным наказанием (лишение премии и т.п.)
3) любого нового пользователя ознакамливаете со статьей 146 УК РФ, а также (при наличии) с историями о наказаниях в прошлом других сотрудников
и да, для пункта 2.1 предварительно должен быть приказ или распоряжение от руководителей целевых пользователей