1. Как и в случае с *ATA винтами кеширование дает прирост производительности. Включать или нет для *ATA/SCSI винтов уже зависит от типа нагрузки и целевого предназначения винта и системы в целом, но подключить UPS лишним не будет в любом случае :)
2. Ничего не делать, отключение укзанных опций только ухудшит производительность
3. Принудительное охлаждение очень не помешает
4. Учитывая что это серверный диск — он не разрабатывался с учетом тишины :) Скорость вращения SCSI в два-три раза выше чем у SATA/IDE так что шуму (и производительности) соответственно больше. Попробуйте поставить его на винты с резиновыми шайбами или любой корпус/карман который гасит вибрации и не передает их на корпус системника. Только имейте ввиду охлаждение. («DO NOT COVER» — значит что нельзя заклеивать или плотно закрывать это отверстие — оно служит для выравнивания давления внутри корпуса и снаружи, помещать винты во внешние корпуса/карманы можно, так как они тоже не герметичные)
PS. про первый/второй вопрос можно почитать в
Microsoft Support: Description of Advanced Disk Properties Features 
