обфускация никак не спасет от попадания на варезники, любой опытный дев без особых проблем "полечит".
помочь могут энкодеры вроде ioncube. но ровно пока ваш продукт не станет популярным и востребованным.
единственный действенный способ оградить код – не отдавать его, а запилить saas.