Языки на сайте

С точки зрения сео согласен, вариант неудачный.
Хотя имеет массу других достоинств, в числе которых легкая и быстрая локализация на другие языки и отсутствие дублирования кода для разных языков (случай скриптов в разных папках).
Если структура сайта разных языковых версий существенно отличается, то этот вариант также сразу можно отросить.