Отключается в простое, или даже если работать с файлами на диске? Отключается в смысле останавливается или выпадает из системы? Если первое - можно попробовать отключить автопарковку головок например с помощью HDDScan или hdparm.
Также можно поэкспериментировать с настройками BIOS например SATA Aggressive Link Power Management, проверить обновления BIOS
