Dim

Решение найдено. Не очевидно, но для того чтобы из приложений ссылки открывались в хроме, нужно добавить ассоциацию с хромом специально для .mht файлов. По умолчанию Сhrome сам этого не делает, и в списке его умолчаний эти файлы не значатся.