С макосью не работал, но скорее всего к вам пришел новый компилятор, нарушающий ABI предыдущего. На возможность подобного указывает то, что вы правили qt-шные правила сборки
Я бы действовал в Генту-стайле: пересобрать Qt с внесенными правками, а затем пересобрать QtCreator. Или, если возможно, получить новые версии из репозитория и того и другого