Daemon23RUS

if (!mysqli_query($connect, "INSERT INTO `users`  .......")) {
    die (mysqli_error($connect));
}

if($_POST["color"] == "red"){   // если color == red,  генерирую файл с помощью подпрограммы
      exec( 'include/getColor'.'  '."red",  $output);  // вызываю подпрограмму, Результат в $output
      var_dump($output);     //вывод правильный
      $color = hex2bin($output[0]);  //  преобразую в HEX байты
      var_dump($color);      //вывод правильный
      file_put_contents("red",$color);    // Сохраненный файл Правильный
    }
     // иначе принимаю файл через браузер в переменную color	
   else{
       $color = file_get_contents($_FILES['userfile']['tmp_name']);
          }

// записываю данные в таблицу
$sql_color=addslashes($color);
$insertQuery = "INSERT INTO ".$this->table." (username, colour) 
      VALUES (
      '".$_POST["username"]."',
      '".$sql_color."'	
      )";

Если создать сайт на отдельном хостинге и получать данные с VDS сервера mysql

or die("Не удается записать запрос в базу данных!");