ChertyakaNUB

Решение: проблема была на стороне IP, которому отправляли запросы! Сообщил им об ошибках, они устранили их.
Так что проблема решена!

Хорошо, что на тостере, там много рук помощи!

P.S.
Пользователь JhaoDa, просто дебил, не понимает вопроса, но меняет тему постоянно! Запомни, ты дебил!

Решение:

curl -i -X PUT -H 'Authorization: token xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx' -d
'{"message": "uploading file",
"content": base64_encode(FILE)
}' https://api.github.com/repos/{USER}/{REPO}/contents/file.ext

Вообщем, если кто-то столкнется с такой же проблемой, решение: используйте сокеты!

Вообщем справился, как всегда сам! Помощи нифига ни от кого не дождешься. Решение:

$ch = curl_init();

curl_setopt($ch, CURLOPT_URL, 'https://api.com/add/?token=TOKEN&id=ID8&value=100&name=TEST');
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, 1);
curl_setopt($ch, CURLOPT_POST, 1);
curl_setopt($ch, CURLOPT_POSTFIELDS, ['file' => new CurlFile($_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . '/upload/test.txt')]);

$headers = array();
$headers[] = 'Content-Type: multipart/form-data; boundary=---011000010111000001101001';
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, $headers);

$result = curl_exec($ch);
echo $result;
if (curl_errno($ch)) {
    echo 'Error:' . curl_error($ch);
}
curl_close($ch);

Передача параметров в URL, а не в массиве.