У вас лишняя закрывающая фигурная скобка. Используйте подсчёт открывающих-закрывающих скобок в редакторе. Открывающих у вас 7, закрывающих 8. И форматирование кода немного съехало - не понятно какая скобка что закрывает. Лишняя стоит перед последним /li . Я в коде её выделил комметом для наглядности.

<?php if ($categories) { ?>
  <div class="container">
    <a class="toggleMenu" href="#">Menu</a>
    <ul class="nav_menu">
      <?php foreach ($categories as $category) { ?>
      <li>
        <a href="<?php echo $category['href']; ?>"><?php echo $category['name']; ?></a>
        <?php if ($category['children']) { ?>
        <?php for ($i = 0; $i < count($category['children']); $i++) { ?>
        <ul>
          <?php $j = $i + ceil(count($category['children']) / $category['column']); ?>

          <?php for (; $i < $j; $i++) { ?>

          <?php if (isset($category['children'][$i])) { ?>
          <li>
            <a href="<?php echo $category['children'][$i]['href']; ?>">
              <?php echo $category['children'][$i]['name']; ?></a>
          </li>
          <?php } ?>


          <?php } //for  i < $j ?>

          <?php } //for ($i = 0; $i < count ?>

        </ul>
        <?php } // if ($category['children']) #8 ?>
      </li>
      <?php } // foreach ($categories as $category) ?>
    </ul>
    <div>
      <?php } ?>