Как две база данных из локального сервера загрузить в одну на хостинге?

Здравствуйте.

1. Filezilla подойдёт.
Тут описание и картиночки для наглядности: www.dummies.com/how-to/content/how-to-change-file-...

2. Да, можете, если Вас не смущают расширенные права ("дыра в безопасности").