Alex

Нужно выбирать платежную систему, которая поддерживает массовые выплаты. Например, Payeer. А дальше все за вас сделает программа, которая работает с API этой платежной системы. Т.е. выставление счета и вот это вот все должен делать ваш сайт/программа. А платежная система только для проведения платежей. Сомневаюсь, что уже где-то есть такой готовый функционал именно в рамках платежной системы.

Не забывайте про 54-ФЗ. Вам нужно выдавать чек физлицу, как только вы получаете от него оплату. Да, на сайте тоже. Поэтому смотрите в сторону тех решений, где есть такая возможность, например Яндекс.Касса.
В модуль-банке сейчас дают онлайн-кассу за рубль, естественно нужно у них РКО оплачивать будет.

Биллинг для Joomla (joomlaplus.ru)