Смотрите, у вас бандлер установлен в системе управления RVM и он же используется. Это видно по путям и на это указали товарищи выше. А при запуске капистрано использует rbenv, пытается найти там бандлер и не находит. Поэтому выпадает с ошибкой.
Варианты решения:
1. Проверьте, что через rbenv установлен банлер нужной версии. Возможно его там просто нет.
2. Проверьте, что он стоит по умолчанию. Возможно, он есть но версии руби переписаны локально и поэтому не находится.
