Решил проблему использованием
wget вместо plink. Достаточно всего лишь одной строчки:
wget http://{mySite.com}/test.php -q
Добавляю:
Благодаря подсказке
Saboteur получилось использовать и
plink. Нужно было в файле
commans.txt просто прописать полный путь к php, то есть вместо
php test.php нужно сделать
{Full}/{Path}/{To}/php test.php Узнать полный путь до php можно, подключившись к серверу при помощи putty и выполнив команду
which php 
