Что касается создания/редактирования pdf-документов на Android, то попробуй Adobe CreatePDF (и его страничка на маркете). Выделять текст и ставить закладки вроде умеет ezPDF Reader. Но оба платны.

Можно попробовать решить проблему так, и это даже вполне удобно. Но более прямого решения, похоже, нет.