Чтобы сохранить историю, обычно новый счетчик создавать не нужно. Переносите тот же счетчик и меняйте в нем адрес сайта на новый домен. Но этого мало еще в Яндекс Вебмастере нужно оформить переезд сайта со старого домена на новый, если у вас переезд сайта.
