blackbeard

Нет - насколько я знаю. Покажите конфиг nginx. Попробуйте nginx -t.

Есть такие вещи, типа OV SSL, EV SSL, в которые Let's Encrypt не умеет, если не ошибаюсь.
+ Страховка за относительно невысокую сумму. Для тех же банков, эти сущие копейки)