RSA в чистом виде плохо подходит для шифрования данных (как и любой другой алгоритм шифрования в чистом виде). Это не надо понимать так, что зашифрованное сообщение можно легко расшифровать. Но два одинаковых сообщения в зашифрованном виде будут совпадать. Считается, что это плохо.
Все ассиметричные шифры работают очень медленно. Поэтому их применяют только для шифрования ключа симметричного шифра, который используется для шифрования сообщения. (Симметричный шифр тоже не применяется в чистом виде, см. Режим шифрования).