Безопасность вещь комплексная и многое зависит от конкретной реализации. То что в одном месте закрывается (и то не факт, так как не известна реализация) один вектор мало влияет на общую безопасность.
Например, у Вас может быть супер защищенный сайт, но рядом у вас в соседней папке у вас лежит приложение, которое принимает команду из пользовательского ввода и подкладывает ее в exec(). Или веб-сервер настроен так, что по отдельным запросам на другие виртуальные хосты отдает содержимое конфиг файлов. Или ньюансы срезания углов при разработке (добавим более тщательную фильтрацию полей позже. ага). Или внезапно выяснилось что в версии вашего ЯП, конкретной библиотеке или субд есть фундаментальная уязвимость.
Хотите комплексно подойти к вопросу? Копайте в сторону изучения материалов от OWASP. Например,
https://owasp.org/www-project-web-security-testing... Там достаточно много материалов для чеклистов. Или смотрите готовые чеклисты что проверять. Например,
https://github.com/0xRadi/OWASP-Web-Checklist (я не говорю что это прям лучший чеклист, но посмотрите на число пунктов для быстрой оценки).
Хотите подойти еще комплексней? Начните с книги для новичков по поиску узявимостей - Ловушка для багов. Полевое руководство по веб-хакингу | Яворски Питер
https://www.piter.com/product_by_id/196618476
А далее например обратите внимание на более сложную книгу как строить защиту в приложениях
Безопасно by design | Берг Джонсон Д., Деоган Д., Савано Д.
https://www.piter.com/product/bezopasno-by-design
Там уже более основательно доводится доводится мысль как выстраивать защиту на основании архитектуры.
