Одно из трех:
1) Просто создавайте .php файл;
2) Нужна интеграция Joomla (доступ к БД и тд), вставьте этот код (пример для корневой папки):
<?php
define('_JEXEC', 1);
define('JPATH_BASE', dirname(__FILE__));
define('DS', DIRECTORY_SEPARATOR);
require_once(JPATH_BASE . DS . 'includes' . DS . 'defines.php');
require_once(JPATH_BASE . DS . 'includes' . DS . 'framework.php');
$app = JFactory::getApplication('site');
$app->initialise();
?>
3) Нужно вставить код в контент, используем модуль, например
DirectPHP.