AxisPod

php.net/manual/ru/function.array-merge-recursive.php

Конектится как к обычному MySQL серверу, на порт указанный в настройках сервера. А дальше все как с MySQL.

Я бы использовал статический метод для инициализации. И который кидал бы исключение в случае, если экземпляр уже создан.
Singleton::init(.....);
Singleton::getInstance()…
Singleton::init(....); // throw exception…

А зачем вам генератор тестов? Может быть вам необходим генератор программного кода, которому достаточно сказать: «Хочу программу», генератор прочитает мысли, сгоняет в будущее, поглядит самый правильный вариант развития событий и выдаст вам готовую программу.

Автоматическая генерация тестов по созданному коду это какой-то бред.

Ну в первую очередь MVC — парадигма, а не паттерн. В данном случае нет жестких требований, тогда как у паттернов требования жесткие. Поэтому возможно и сложно было найти, т.к. люди понимают MVC как хотят.

Учитывая факт, что тормозит, следует проверить дисковую систему и инет канал, имеет смысл выполнить локально ab. Вообще я бы советовал начать с strace, хорошо покажет время выполнения системных вызовов, проблем может быть множество.