У меня есть опыт работы с MS SQL Server, работал также с MySQL и SQLite.
MS SQL Server вполне удобная и хорошо справляется с большими объемами данных - она думаю подойдет вам лучше других.
Бесплатная версия Express до 10 Гб годится.
У вас же всего лишь 50 000 товаров\статей\страниц, метки, категории ... - довольно маленький объем.
Тормозов не будет, если конечно индексы правильно создадите под тяжелые запросы.