Для удаления Inlinekeyboard в сообщении его можно заменить на пустую клавиатуру
но для начала нужно узнать message_id сообщения в котором мы хотим заменить клавиатуру с помощью метода
.message_id:
msg_id= bot.send_message(message.chat.id,'Текст',reply_markup=markup).message_id
Потом мы заменяем
bot.edit_message_reply_markup(chat_id=message.chat.id,message_id=msg_id,reply_markup=types.InlineKeyboardMarkup())
