ArcadyP

Для меня ваш вопрос тоже актуален.
Присматриваюсь к Xojo и Wakanda, но это экзотика и использовать в реальных проектах, сомнительно. Неизвестно какая их ждет судьба в дальнейшем (вдруг закроются?)
А вы в итоге остановились на чем-то?

Топик, конечно, устарел, но наткнулся только сейчас:
Возможно, наиболее, надежный способ - это обмен файлами (xml или csv).
Есть еще вариант обратится к FileMaker Server по http-запросу, заставив его исполнить нужный скрипт с нужными параметрами. На выходе вы получите xml с данными того лайота, на котором закончил работать скрипт. То есть FM вернет вам, те данные которые вы у него запросите (в вашем случае, например, новый выписанные счета).
Подробно техника описана тут:
fmteam.ru/vypolnenie-skriptov-na-servere-v-filemak...

Наткнулся на вопрос:
FileMaker Server можно заставить запустить скрипт используя http-запрос, при этом передов скрипту нужные параметры.
Вот здесь статья с общим описанием метода: fmteam.ru/vypolnenie-skriptov-na-servere-v-filemak...

Еще FileMaker Server может исполнять php код, там же на сайте посмотрите статьи с тегом php