C# всего лишь язык программирования. Как и все остальные. Вопрос в практической реализации. Существует же проект Mono на Linux, пусть и со всеми недостатками. И потом, всё же есть молодой проект для Linux на .NET Core от Microsoft. Вполне рабочий. Касательно GUI из него пока не знаю.
