Случайно наткнулся на этот свой старый вопрос и вспомнил как решил проблему. В общем у меня был свой VDS и несколько сайтов на другом хостинге. Один из сайтов перенес с хостинга на VDS, вот только после переноса у хостера забыл в панеле отключить wget. У меня там был скрипт обновления базы раз в сутки с различными параметрами настройки характерными для бывшего хостига (пути файлов и т.п.), и т.к. стоял адрес сайта, то он благополучно откликался, но скрипт на новом VDS пытался найти прежние пути файлов и прочую ерунду из мускуля. В общем вывод - при переносе сайтов нужно следить за всем, даже за настройками "бывшего" сервера.