Если на сайте работает все так как надо и пользователь не видит копеек. То можно просто округление добавить в "модуль объекта" в документ Заказ в УТ, процедура ПередЗаписью(<Отказ>, <РежимЗаписи>, <РежимПроведения>) .
Каждый раз при записи вашего заказа в УТ, будет все само округляться, думаю что это самое простое решение.