Для девелопмент сервера (devname.sendbox.site.ru) я использую схему reverse-proxy: основной apache2 обслуживает виртуальные хосты и проксирует все запросы вида project.developer.dev.example.com на второй apache2, который резолвит хост project.developer.dev.example.com в путь /home/developer/vhosts/project.htdocs.
Такая схема позволяет использовать несколько версий php5 (достаточно их собрать, сделать новые скрипты запуска и добавить правила) и позволяет создавать новые хосты безе перезапуска apache2.
Для деплоя на qa у нас настроен Jenkins job.
