Для устранения фрагментации системного раздела можно обойтись без дефрагментатора:
создать wim-образ раздела посредством DISM++, отформатировать его и восстановить из образа. Единицей wim-образа является файл, поэтому после восстановления из образа фрагментация исчезнет.