Ответ -
"Два драйвера есть потому что они немного разные.
lsi-mr3 - это native драйвер, сделанный специально для ESXi
scsi-megaraid-sas - это 'legacy' драйвер, который портирован с линукса.
native драйвера имеют преимущество перед legacy и используются по умолчанию при наличии."