Специалист банка ошиблась. Я расковырял коды swift, и попросил пояснений в банке. Межбанковский перевод уже был в евро. А специалист банка подумала, что он в швейцарских франках. Месяц мучений зря.
В моем swift сообщении есть следующие поля
:32A:200715EUR1000,
:33B:CHF1100,
Вот коды которые есть в сообщении swift
https://en.wikipedia.org/wiki/MT103
:32A: это то что пришло по межбанку. То есть конвертация была еще на стороне отправителя и по межбанку уже шло 1000 евро.
:33B: это просто справочная информация насколько я вижу, о том что изначально до конвертации сумма была в франках.
Коды оригинальные из моего сообщения. Суммы поставил рандомные.
По итогу повторного обращения в банк они отписали, что всё было сделано верно и никаких проблем со счетом в евро далее не будет. Никакой курс швейцарского франка к евро указывать не нужно.
Мда :)