А гит тут причем?) Иницируй проект на ПК npm install. Нода подкачает исходники под текущую платформу.
В любом случае на свой страх будешь работать, потому что лучше всего делать проект там, где будет крутиться в проде. С другой стороны, нода довольно кросплатформенная вещь, и модули у нее популярные есть с хорошей кросплатформой, но никто кроме твоего многолетнего опыта за это не ответит. Дерзай и отпиши сюда через год с выложенным package.json