Что делать если Js не хочет вынимать 0-вой елемент из массива?

Вы сравниваете элементы HTMLCollection и Array, и получаете правильный ответ.

Но я о другом.

var elementsAsHTMLCollection = document.getElementsByClassName('tags-list__item');
var elementsAsArray = Array.from(elementsAsHTMLCollection);

elementsAsHTMLCollection === elementsAsArray; // false