Александр

Поставьте хотя бы демо-версию Keil'а. Ограничения в 32kB кода для начала будет болчее чем достаточно.
Готовые примеры так же можно найти в сети.
Минимальный - настройка GPIO, и через таймер менять состояние пина.
Например, вот так:

int main(void) {
	RCC->AHBENR |= RCC_AHBENR_GPIOAEN;
	GPIOA->MODER |= 1;	// GPIOA.0.MODE -> out mode
	GPIOA->OSPEEDR |= 3;	// GPIOA.0.SPEED -> MAX SPEED
	while(1) {
		for (uint32_t i=0;i<1000000;i++) {};		// Пауза
		GPIOA->ODR ^= 1;	// Toggle GPIOA.0
	};
};

Вот этот код будет мигать пином PA0.

Странно. У меня запускался нормально.
Попробуйте перенести настройку Flash памяти ДО смены основного тактового генератора.
Помнится, на высокой рабочей частоте данные просто не смогут выбраться.
В остальном в коде, похоже, всё в порядке.

Если работаете в отладчике - можете прямо в процессе выполнения идти по инструкциям где-то после:
RCC->CR |= RCC_CR_PLLON; // Запустить PLL
И точно увидите, где возникает проблема.

Кстати, либо можете перенести строки
RCC->CFGR &= ~RCC_CFGR_SW; // Очистить биты SW0, SW1
RCC->CFGR |= RCC_CFGR_SW_PLL; // Тактирование с выхода PLL
while((RCC->CFGR & RCC_CFGR_SWS) != RCC_CFGR_SWS_1); // Ожидание переключения на PLL
непосредственно после flash->acr