Мы решили это так:
При получении события photo_comment_new делаем запрос к API ВК
https://api.vk.com/method/photos.getById и там проверяем, есть ли у данного изображения post_id, если есть, значит картинка прикреплена к посту и игнорим это уведомления т.к. с ним придет одновременно и wall_reply_new