Свою проблему я решил - копанием в логах аудита, выяснил что причиной остановки была остановка mariadb.service.
Конфиг приложения был:
[Unit]
Description=Site host
After=httpd.service
After=mariadb.service
Requires=mariadb.service
....
После выпиливания "Requires=mariadb.service" сервис перестал останавливается сразу же после остановки mariadb.
Может кому поможет.