Поизучайте как именно работает статистика планировщика. Ну, например,
https://habrahabr.ru/company/pgdayrussia/blog/329542/
Есть default_statistics_target (дефолт 100) и именно столько штук самых популярных конкретных значений отслеживается в most_common_vals и most_common_freqs. Что можно сказать про все остальные значения? (число разных значений есть - n_distinct) Что они как-то могут быть распределены по (100%-sum(most_common_freqs)) оставшимся строкам. В сущности, в статистике нет других значений кроме most_common_vals и потому нельзя сказать, есть ли вообще хоть одно искомое значение. А как они там распределены, если есть? Да кто их знает. Планировщик предполагает, что примерно равномерно.
Соответственно можно крутить default_statistics_target для конкретного поля или индекса.