Остановить работу php?
Сделай файл trigger.txt в котором при запуске должно установится текст 1 и цикл в php будет проверять наличие этой единицы каждую итерацию и при 0 завершит работу.
А через ajax ты и будешь отправлять этим переключателем. Устанавливая 0 - отправив запрос остановиться.