Тоже столкнулся с такой проблемой. У домру беру 600 мб. Через микрот скорость туда обратно 230-250 мб. Включил fasttrack на forward: скорость на доунлоад норм, на аплоад попрежнему резало. Добавил fasttrack на uotput и все стало норм в соответствии с тарифом. Надо заметить, если используете mangle по какимто своим причинам, то это взаимоисключающие "фишки" mikrotik.
/ip firewall filter add action=fasttrack-connection chain=forw
ard comment="default configuration" connection-state=established,related
/ip firewall filter add action=fasttrack-connection chain=output comment="default configuration" connection-state=established,related